Home

Ср, 9 Дек, 2009, 23:39
Некролог Компьютерре.

Сергей Вильянов, редактор www.computerra.ru, сообщил на
http://helpix.ru/forum/index.php?s=3fe3d9b24d35d80888f3d7ee424d4ed7&showtopic=5213&st=0

что 14 декабря выходит последний бумажный номер журнала Компьютерра, в котором будут собраны лучшие статьи за прошедшие 16 лет и 810 номеров.

Главная причина закрытия журнала - нехватка рекламодателей. Последний год в номерах явно пустовали рекламные полосы, и долго это продолжаться не могло.

Сейчас на www.ctinside.com/2009/12/810.html#comments идет реакция читателей и она почти совпадает с реакцией в других местах Сети - "Будто друг умер.", "единственый журнал, который я читал.", "Теперь читать вообще нечего..." .

Ктерра сильно выделялась из общего ряда. Во-первых - еженедельный формат, который к концу 90-х перерос из газетного в полноценный качественный журнал. Это позволяло освещать новости гораздо оперативнее ежемесячных журналов да и просто писать больше.

Но читали КТ не из-за новостей. Обычно у каждого номера была "Тема Номера" - две-три большие статьи о чем то одном - ядро номера, очень часто написанное приглашенными людьми, специалистами в своем деле, которых правили или просто дополняли редакторы.

Тему ращбавляли постоянные рубрики штатных авторов, чуть-чуть новостей и все вместе, каждую неделю, почти 10 лет создавало журнал, равного которому в его нише на русском языке не было.

Году в 2000м или даже раньше, преп.Ваннах (он реально священник) между делом заметил на страницах КТ, чем отличается информация от знания. Вроде бы почти одно и тоже, и часто перетекает из одного в другое, но на деле - разница принципиальная. Ваннах привел хороший образ - информацию добывает разведчик, и если его захватывают, то обычно уничтожают. Знание добывает ученый, и если его захватывают, то уничтожают крайне редко - обычно наоборот, начинают беречь больше своих солдат.

Так вот редакторы КТ очень много усилий тратили на "повышение содержания знаний в тексте". Статьи бывали всякие - просто информативные, научно-популярные и никаим боком не связанные с компьютерами, но главной ценностью были статьи, которые явно раздвигали знания читателя. Не информированность - в КТ были редки обзоры железа и новости железа. Они были, но... явно были чем-то второстепенным к главному. Поэтому журнал читали те, кому давно надоели новости "Компания А выпустила новый Б, отличающийся от В, тем что г, д, еклмн..."

Многие, просмотрев несколько номеров КТ, с раздражением говорили "журнал ниочём". Всё верно - это был журнал не "О чём", а "Для кого". Для мужского пола от 6 до 40, имеющего дома компьютер, говорящего по-русски, и любящего читать книги, главным образом научную фантастику. По-крайней мере в детстве любившего. Вот такими косвенными, но много о чем говорящими признаками можно было обвести аудиторию журнала. И замены ему для нас нет.

Ближайший аналог - Популярная механика, выходит раз в месяц и... новости там уже устаревшие, да и прицел несколько сбит в сторону.

Я читал КТ с 99 года. До 2007 по сети (архив выкладывали), потом стал выписывать. Временами беря в руки журналы-конкуренты, пролистывал, прочитывал, иногда удивлялся слабости текстов, реже думал "это могло бы пойти в КТ". Более качественныго компьютерно-научно-поплуряного журнала на русском я не видел. Статьи сильнее ьыли только в специализированных изданиях, выпускающихся для узких специалистов.

В чем главнейшее отличие КТ от, какого нибудь Chip или Upgrade ? Подшивку КТ за 2005 или даже 2000 год можно спокойно перечитывать. Именно благодаря Темам Номера, которые очень часто с годами не устаревают. Там знания, а не "инфа". А номер типичного железячного журнала через два года интересен... только вяло поудивляться, что прекрасная мелованная бумага стала годна лишь для растопки камина.

Номера КТ, например о Фестском диске и Манускрипте Войнича, или о сложностях компьютерной игры в Го, или, или... да потыкайте наугад в номера золотой поры: 1998 - 2005 год, в четверти случаев будет чтение на вечер и пища для ума. А не жвачка с обзорами или тупым сравнением "Десять моделей ... бюджетного ряда для дома и офиса".

Единственное, чего мне слегка не хватало в КТ - рубрик типа "Сделай сам", причем не на компьютере, а руками. Очень редко бывали статьи, описывающие, например, как редактор разобрал фотоаппарт, снял ИК-фильтр с матрицы и получил инфракрасную камеру. А надо было бы подобные статьи хотя бы ежемесяно, если не в каждом номере. И ведь их было кому писать - Леонов, редактор, а примерно год и главный редактор - исключительно грамотный и рукастый человек, думаю, затыкающий за пояс того же Артамонова с Фцентра. Ему, например, не составляло труда переставить экран из одной Сони-Ридер в другую, по просьбе Козловского (который, навереное, и паяльник ни разу лудил). Помнится, Башилов (еще один редактор), сделал отличную статью о самодельной антенне для Скайп-телефона - из куска текстолита и кабеля, которая давала "пять палок" на даче, где телефон вообще сигнал не ловил. Текст был выложил на ферру.ру, а в журнале кажется так и не появился.

По слухам, установка "Никакой самодельщины" была чуть ли не редакционной политикой, по крайней мере в первой половине 00-х годов. Ну а после уже по инерции... Думаю, эта грубейшая ошибка позицинирования уменьшала на процентов 10-15 аудиторию.

Вильянов пишет, что www.computerra.ru, почти изначально самостоятельный проект, с закрытием журнала никуда не денется. Судя по его развитию в последний год - в это можно верить. Надеюсь, многие авторы бумажной продолжат писать и для сайта. Тем более, что по словам Вильянова разница в гонорарах небольшая.

Может быть и я туда напишу...

Чт, 26 Ноя, 2009, 13:04
Зарос после переливания.

Нашел российский журнал клеточной терапии... Читаю, почитайте и Вы.

На всякий случай поясню термины.

гемопоэтические стволовые - стволовые клетки крови (взрослые. у Вас их много)

донорский химеризм - степень "срастания" чужих клеток с новым хозяином.

иммунносупрессия - подавление иммунитета. Обязательна при пересадке (исключая пересадку от однояйцевых близнецов). В данном случае проводилась потому, что перелитые от брата клетки остались расти в человеке "навсегда".

аутоиммунный патогенез alopecia universalis - облысение в результате атак на волосы собственнлого иммунитета человека. Одна из теорий "почему мужики лысеют".

--------http://old.celltranspl.ru/news/apr/23-04-04.html
Клиническое наблюдение: случайное исчезновение алопеции после трансплантации гемопоэтических стволовых клеток.


Случай очень интересный и описан в online-выпуске журнала Blood. 40-летнему мужчине выполнили аллогенную трансплантацию гемопоэтических стволовых клеток периферической крови от HLA-идентичного сиблинга (брата) по поводу хронического миелолейкоза, диагностированного 5 месяцев назад. Кроме того, пациент около 12 лет страдал общим облысением (alopecia universalis). Заболеванием аутоиммунного генеза, с потерей волос на разных участках тела, включая ресницы и брови. Семейный анамнез неблагоприятен по аутоиммунным заболеваниям и лейкозу.

Трансплантации предшествовала миелосупрессия циклофосфамидом и облучением. Через 100 дней после трансплантации, прошедшей без осложнений (инфекции, реакции трансплантат против хозяина), наблюдалась полная гемотологическая ремиссия заболевания и 100% донорский химеризм.

Неожиданно, начиная с 40 дня после трансплантации у пациента стали рости волосы на подбородке и верхней губе, а затем на голове и груди. Появились брови и ресницы. Исследование биоптатов волосянных фолликулов не выявило никаких признаков донорского химеризма.

Однако через 180 дней появились признаки выпадения только что выросших волос. Биопсия показала наличие перифолликулярных лимфоидных инфильтратов. В это время была диагностирована хроническая реакция трансплантат против хозяина с преимущественным поражением печени, которая постепенно регрессировала при смене режима иммунносупрессии.

Общее время наблюдения составляет 2 года. Рост волос за это время "стабилизировался" и представлен на фото.

Выводы таковы:
- работа подтверждает аутоиммунный патогенез alopecia universalis;
- трансплантация гемопоэтических стволовых клеток может полностью коррегировать это заболевание, имеющее генетическую основу (связьс HLA-DRB1* 0401);
- введённые клетки, по видимому, прямо не участвуют в регенерации волосянных фоликуллов, а лишь опосредуют их восстановление, за счёт коррекции актоиммунного компонента (снятия блока антитела с антигеном фолликула).


Кстати, аналогичный случай был описан 2 года назад, но после аутологичной трансплантации гемопоэтических клеток [1].


По материалам
Blood First Edition Paper, prepublished online April 8, 2004; DOI 10.1182/blood-2004-01-0136

Литература:
1. Feher O, et al. Alopecia universalis completely resolved following autologous bone marrow transplantation. Arch Dermatol 2002; 138: 1102-1103

Пн, 23 Ноя, 2009, 00:20

http://zamorin.livejournal.com/323608.html

их убийца не жалел нашего священника
ему не жалко родителей, вдовы, трех дочерей
их правая вера держит нас за изменников
и желает прочим ахль-аль-китаб исчезнуть скорей

"если Иисус - Бог, то сотрясутся от лжи горы"
их книга, которая так без обиняков и говорит
а наше Писание вещает, глаголет и вторит
что Бог ВСЕМ одинаковым солнцем Христа горит

Иисус как и всех любит убийцу стрелявшего
от рождения и до суда в конце веков
и принял теперь отца Даниила, упавшего
в объятья Михаила Архангела и собора его

мы поздравляем мученика отца Даниила
с тем, что он стоит с Архангелами у Креста
и наградою вечною нам его жизни недлинная,
что сияет в руках у Бога истинна и проста

Сб, 14 Ноя, 2009, 22:48
Ролевые обощения

Давно перестав активно интересоваться политикой, случайно встретил интересное сравнение соврменной полит-ситуации в РФ.

-----------

Сергей Егишянц: Мне кажется, что эта модель "старший-младший", где Медвед выступает в качестве клоуна-марионетки, мало связана с реальностью - во всяком случае, история жизни Путина и Медведева в 1990-е наводит на изрядный скепсис к такому восприятию: у каждого из них есть немало что рассказать о другом - так что тут не д.б. улицы с односторонним движением


wilenski: Я бы точнее и полнее описал совеременную модель политической верхушки ЭрЭф как "триумвират", в котором состоят:

"Регент" Путин, умный, властный, сильный, смелый, решительный, жестокий и опытный политический и экономический хищник, который напрямую управляет своими воеводами и придворными магнатами (силовиками и олигархами), откупщиками (чиновничья Вертикаль Коррупции, то есть централизованная система интенсивного грабежа населения и разворовывания ресурсов страны) и вассалами (Кадыров и его подобия, для ясности здесь важно древнее феодальное определение: "вассалы вассалов Регента -- не вассалы Регента");

"Кардинал" Сурков, гениальный манипулятор, который напрямую управляет СМИ (в первую очередь ТВ), боярами (Гос. Дума и "политические партии") и наместниками (губернаторы областей с русским населением);

"Инфант" Медведев, который формально является Главным, но которому Регент и Кардинал выдали лишь потешные погремушки (Интернет, инновации, борьбу с алкоголизмом, энергосберегающие электрические лампочки, часовые пояса, светлое будущее) -- для того чтобы Инфант не расстраивался, но наоборот тешил бы себя иллюзией участия в управлении страной и в её развитии. Удивительно, насколько удачно Регент и Кардинал подобрали личность Инфанта, и насколько точно эта ничем не выдающаяся личность соответствует своему унизительному и скоморошному положению Голого Короля.

Хотя теоретически Инфант может проявить решимость и власть, но видно невооружённым глазом, что этот человек может выполнять в лучшем случае роль Свадебного президента, а управлять страной при нём всегда будут другие люди. Хитрый Кардинал держится в тени, имеет больше друзей, чем врагов, и всем кажется полезным и нужным, в любой сложной ситуации он найдет себе оправдание и новое применение. Поэтому исторически неизбежная смена режима в ЭрЭф не обязательно должна означать немедленный уход Инфанта со своего формального поста, и выход Кардинала из политической игры, смена режима означает только уход Регента --- поэтому с углублением кризиса, с нарастанием "революционной ситуации" Регент будет все яснее ощущать своё одиночество и изолированность, предательство своих "пацанов", потерю контроля, а потому надо ожидать что он будет действовать всё истеричнее и жёстче...
-------

Вт, 27 Окт, 2009, 13:02
Немного о зубных имплантатах.

взял со Stomatologia.By. автор текста не указан

Операция по установке дентальных имплантатов: хроника событий.


Я ортодонт, в профессии с 1976 года. Время от времени ко мне обращаются пациенты, которые потеряли (потеряют) один или несколько зубов. Обычно для разрешения этой проблемы я рекомендую им использовать дентальные имплантаты. Как оказалось, моя профессия отнюдь не является пожизненной прививкой против пародонтоза. Когда я понял, что вскоре потеряю два передних зуба, то решил воспользоваться собственным советом и поставить два имплантата. На протяжении множества лет мне многократно приходилось совершать чистки, лечить кариес, устанавливать коронки, удалять зубы и делать хирургию десен. В результате у меня сформировалось отчетливое представление о том, насколько неприятными и пугающими могут быть стоматологические процедуры. Возможно, мой рассказ поможет вам, как он помог мне.
Read more )

Вс, 25 Окт, 2009, 10:53
Выбираем аккумулятор

econom.far.ru/?auto06

Аккумуляторов нынче в продаже множество. Но даже с батареями именитых фирм не все просто. Когда-то это был добротный, но дорогой товар, "самый удачный выбор для тех, кто в состоянии платить". Купил и забудь об АКБ на несколько лет. Но глобализация изменила и это. Даже когда-то бывшая почти эталоном надежности немецкая Varta с переходом под контроль концерна Johnson Controls и пуском завода на Украине стала гнать откровенный брак, дохнущий в первый же год эксплуатации. Нарекания на качество именитых батарей Bosch продолжаются уже много лет подряд, и если сначала концерн объяснял проколы тем, что на русский рынок поступили батареи с давно истекшим сроком годности, потом - что батареи, мол, поддельные - то теперь всякому стало ясно, "что-то прогнило в этом королевстве". Теперь уже никакая высокая цена и никакой громкий бренд не гарантируют качества. И больше того - именно дорогие батареи раскрученных марок прежде всего фальсифицируют (сюда же относятся и забавы с перемаркировкой даты изготовления фирменных батарей - благодаря чему в продажу идут совершенно "протухшие" за три года хранения на европейских складах изделия).

Попробуем же разобраться в том, что предлагает рынок рядовому владельцу бюджетной иномарки или отечественного ВАЗа.
Read more )

Вс, 11 Окт, 2009, 22:06
Октябрь 1993-го. Изнутри и со стороны.

http://borko.livejournal.com/486485.html Перевод на русский прекрасной статьи американца-участника октябрьских событий в Москве 93-го.

Вс, 4 Окт, 2009, 12:53
Слабые и глупые.

Пришла очередная рассылка с онлайн-интервью Стругацкого… Его очередной раз спрашиваю про религию и веру в светлом будущем Полдня (слабо им поискать такие же вопросы-ответы за прошлые 9 лет). Он очередной раз отвечает: “Религия будет существовать всегда, пока будут существовать одинокие и слабые.” Меня это очередной раз слегка задело и, по безделью, перед сном, опять об этом задумался минут на семь-восемь.

Итак, тезис: “Люди религиозные – (обычно) одиноки и слабы (духом)”. По себе лично – у меня возражений классику фантастики нет. Слабый – это слабо сказано. Будь мне подобные большинством верующих, Б.Н.С. мог бы справедливо писать куда более задевающие суждения. Правда, глядя на демонстрации всяких палестинцев с иранцами, понимаешь, что слабых и одиноких среди этих центурий религионеров (причем живо верующих, с делом) не очень-то много… Утешает. Но думал я не об этом.

Из чего обычно выводят этот тезис и чем обосновывают? Общим местом для объяснения истоков религии, причем не только в рассуждениях атеистов, но и некоторых богословов, является неизбежность смерти и страх перед ней. Осознание её и его, говорят нам мудрецы, это одна из главнейших колон, на которых люди, особенно «слабые и одинокие», выстраивают фантазии, которые помогают справляться с трудностями. Такая вот неосознаная само-психо-терапия - верит человек в рай и меньше страдает от тягот, меньше ужасается приближением к могиле.

Оставим за скобками древние религии, типа греческой, которые убеждали людей в такой посмертной участи, что она была не утешением, а наоборот – дополнительным фактором депрессии. …. Далее я хотел написать длинный текст с мысленным экспериментом: «Давайте уберем смерть из жизни, представим что реинкарнация реальна и мы все помним с десяток своих последних воплощений. Поэтому смерти вообще не боимся. Многие даже специально ее используют для катапультирования из неудобных ситуаций. (да, я читал Мир Реки.). Представили? Ну и как, верующих среди нас тогда будет меньше?» Очевидно, не меньше.

Но потом понял, что этот довод – плохой. В таком мысленном эксперименте мы, убирая из объяснений религии одну колону (страх смерти), ставим на ее место другую – опытное знание несводимости Я к материальному телу. Такое знание, конечно, будет посильнее Фауста Гёте. А вот если не ставить вере новых подборок, а страх смерти почти убрать, реализовав практическую почти-бессмертность всяким технологическими штуками (читаем кибер-нано-панк)? А? Вот тогда-то верующих и поубавится… Вот тогда-то жить станет легче, жить станет веселее.

Посольку мысленный эксперимент с заменой смерти реинкарнацией - плохой, предлагаю вместо него аналогию.

Тезис 1: Среди людей есть слабые духом.
Тезис 2: Хорошая Церковь делает своих прихожан - сильнее духом.
Вывод: В Церковь идут большей частью слабые духом. А тем, кто сам по себе силен духом - Церковь не нужна.

Аналогия
Тезис 1: Среди людей есть слабые умом.
Тезис 2: Хорошие университеты делают своих прихожан - сильнее умом.
Вывод: В университет идут большей частью слабоумные. А тем, кто сам по себе умён - университеты ни к чему. Во многое знание – много печали.


P.S. Кстати, по поводу формальной логики - что там писал про религию и веру в богов Аристотель? Кто знает – процитируйте пожалуйста.

Вс, 27 Сент, 2009, 22:33
Цели вроде разные, результат - одинаковый.

http://a-lamtyugov.livejournal.com/474246.html

Операция "Коттбус", 22.06 -- 03.07.1943, Борисов, Белоруссия
Уничтожено партизан: 4500 (+500 по подозрению)
Потеряно немецких солдат: 59
Соотношение: 1:84,75
Захвачено стрелкового оружия: 571 единиц
Оружие/уничтоженные партизаны: 1:8,76

Выдержка из письма генерального комиссара Белоруссии министру по делам восточных территорий:

...Если при 4500 убитых на стороне противника захвачено всего только 492 винтовки, то эта количественная разница говорит о том, что и среди этих вражеских убитых находятся многие местные крестьяне. Особенно известен тем, что он уничтожает множество человеческих жизней, батальон Дирлевангера. Среди 5000 подозреваемых в принадлежности к бандам, которые расстреляны, имеется много женщин и детей...


Операция "Спиди Экспресс", декабрь 1969 -- май 1970, дельта Меконга, Вьетнам
Уничтожено партизан: 10889
Потеряно американских солдат: 40
Соотношение: 1:272,23
Захвачено стрелкового оружия: 748
Оружие/уничтоженные партизаны: 1:14,56

Мораль: имея ганшипы, можно жечь значительно круче, чем не имея таковых.

Вс, 20 Сент, 2009, 12:51
О гриппе А (H1N1) с точки зрения программирования

оригинал на www.kv.minsk.by/index2009364402.htm


Учёные уже полностью дизассемблировали H1N1 и занесли его в вирусную базу NCBI Influenza Virus Resource (ncbi.nlm.nih.gov/genomes/FLU/SwineFlu.html). Там всё задокументировано в подробностях. Например, образец A/Italy/49/2009(H1N1) был обнаружен в носу 26-летней женщины, вернувшейся из Италии в США. Вот первые 120 бит его генетического кода.

atgaaggcaa tactagtagt tctgctatat acatttgcaa ccgcaaatgc agacacatta


Сколько бит убьёт человека?

По приблизительным подсчётам, общий размер исходников H1N1 составляет 26022 бита, а если исключить служебные стоп-сигналы (указывают на окончание каждой белковой последовательности), то исполняемый код составляет примерно 25054 бита. Это число является приблизительным ещё и потому, что в вирусе присутствует механизм генерации избыточного мусора для маскировки от антивирусов.

Итак, получается около 25 килобит или 3,2 килобайта. Таков объём кода для программы, имеющей ненулевые шансы убить человека. H1N1 написан гораздо эффективнее, чем компьютерный вирус MyDoom размером около 22 Кб.

Очень унизительно, что меня могут убить всего 3,2 Кб генетических данных. Впрочем, в 850 Мб человеческого генома по-любому должны быть дыры для парочки эксплойтов.


Молекулярная биология

Для не знакомых с молекулярной биологией короткий ликбез (ru.wikipedia.org/wiki/Генетический_код). Символы из вышеприведённого кода называются нуклеотидами. Они бывают четырёх типов (A [T/U] G C), то есть каждый символ содержит два бита.

Исходный код живого организма (последовательность нуклеотидов ДНК) загружается в оперативную память (транслируется в последовательность нуклеотидов РНК один к одному, разве что T заменяется на U), компилируется в виде кодирующих тринуклеотидов (кодонов) и запускается на исполнение (по кодонам происходит синтез аминокислот конкретного организма).

Когда программу РНК запускают на исполнение, начинается синтез аминокислот. Они создаются по одной аминокислоте на каждые три нуклеотида. Вышеприведённый генетический код можно представить в виде такой последовательности базовых аминокислот.

MKAILVVLLYTFATANADTL

Каждый символ в этой записи (кодон) эквивалентен шести битам информации (три двухбитных нуклеотида). M - это метионин, K - лизин, A - аланин и т.д. (см. таблицу аминокислот: en.wikipedia.org/wiki/List_of_standard_amino_acids).

Интересно, что генетический код любого живого организма начинается со стартового кодона М. В природе это обязательный маркер валидного кода.

Поскольку ДНК и РНК - это практически одно и то же, то в биологии принято любой генетический код записывать в виде последовательности нуклеотидов ДНК, даже если в природе этот код распространяется непосредственно готовый к запуску, то есть в виде РНК, как вирус гриппа. Это очень важная деталь, о которой мы поговорим ниже.

Однако, вернёмся к основной теме статьи. Приведённый код - это начало гена HA, который программирует производство белка гемагглютинина (ru.wikipedia.org/wiki/Гемагглютинин). В нашем образце присутствует гемагглютинин подтипа H1, что и отражено в названии вируса H1N1.



Гемагглютинин - это интерфейс для присоединения к клетке-хозяину. Если представить живые существа в виде компьютеров, то каждая функциональная группа клеток в организме выходит на связь с внешним миром через определённый порт. Например, порт 25 предназначен конкретно для протокола FTP. В вирусе гриппа порт H1 указывает на конкретную область человеческого тела (горло), к которой можно присоединиться. Любопытно, что тот же самый H1 подходит для присоединения к кишечному тракту птиц. Поэтому один и тот же вирус H1N1 способен атаковать и респираторную систему людей, и пищеварительную систему птиц.

Для сравнения, другой порт H5 (часть вируса H5N1, известного как "птичий" грипп), нацелен на атаку лёгочной ткани, что приводит к пневмонии, поэтому H5N1 намного опаснее и вызывает гораздо больше смертей. Поражение через порт H1 совсем не так страшно: человек просто начинает сморкаться, но лёгкие не страдают.

Учёные до сих пор продолжают изучать порт H5. Уже известно, что у некоторых людей-мутантов лёгкие не способны соединяться с вирусом по этому порту. У кого есть такая мутация в генах, имеют большие шансы безболезненно пережить эпидемию H5N1, если она вдруг начнётся.


Взлом свиного гриппа

В журнале Nature опубликована отличная статья (nature.com/nature/journal/v459/n7249/full/nature08157.html), где собрана вся информация о текущей структуре вируса H1N1, его сравнение с другими штаммами гриппа. Автор подробно рассказывает, чем у них отличается патогенная компонента, то есть именно та часть, которая убивает человека.

Обладая этой информацией, я теперь точно знаю, как нужно модифицировать исходники H1N1, чтобы сделать его более смертоносным.

В статье написано, что ген PB2 с глутаминовой кислотой в 627-ой позиции обладает слабой патогенностью (не очень смертелен). Однако, вариант с лизином на той же позиции более смертелен. Хорошо, найдём это место в исходниках H1N1. Информация из базы данных:

601 QQMRDVLGTFDTVQIIKLLP

621 FAAAPPEQSRMQFSSLTVNV

641 RGSGLRILVRGNSPVFNYNK

Как видим, на 627-й позиции кода вируса стоит символ "E", это и есть кодон для глутаминовой кислоты. Слава богу, что здесь именно он, поэтому от H1N1 умирает не так много народу, как могло бы.

Если раскодировать кодоны в исходный код ДНК, то мы получим:

621 F A A A P P E Q S R

1861 tttgctgctg ctccaccaga acagagtagg

Как видно, глутаминовой кислоте соответствует последовательность нуклеатидов "GAA". Чтобы модифицировать геном и сделать вирус более смертельным, нам нужно всего лишь заменить "GAA" одним из двух вариантов лизина ("K"), то есть "AAA" или "AAG". Таким образом, более смертоносный вариант H1N1 будет иметь такой вид:

621 F A A A P P K Q S R

1861 tttgctgctg ctccaccaaa acagagtagg

Вот так. Поменять всего два бита - и практически безвредный H1N1 превращается в более смертоносный вариант.

Теоретически, я могу использовать вполне доступные технологии для синтеза нового вируса. Для начала я могу обратиться в одну из коммерческих компаний, которая занимается синтезом ДНК (например, Mr. Gene, mrgene.com) и заказать конкретную последовательность ДНК дешевле чем за $1000. Правда, нужно учесть, что фирма Mr. Gene применяет процедуру скрининга для выявления потенциально опасного биологического кода. Сложно сказать, среагируют ли их фильтры на этот модифицированный вариант гена. Если так, то можно заняться производством нового вируса и без их помощи. Для этого нам нужно достать образцы обычного H1N1 и применить опять же хорошо известные и стандартные техники для контролируемой мутации генома, чтобы заменить нужный нуклеотид.

Кстати, в журнале Nature есть даже ссылка на другую научную статью (pnas.org/content/96/16/9345.full.pdf+html), в которой подробно рассказывается, как самостоятельно сделать вирус гриппа А [Neumann, G. et al Generation of influenza A viruses entirely from cloned cDNA. Proc. Natl Acad. Sci. USA 96, 9345-9350 (1999)]. Тоже интересное чтиво.


Находчивый грипп

Перед тем как модифицировать вирус H1N1, давайте подумаем. Матушка-природа сделала гениальную работу, упаковав смертельный код всего в 3,2 Кб, да так, что мы не можем с ним справиться. Видимо, она не так глупа. Наш маленький хак не станет для неё откровением. Может быть, грипп способен поменять пару бит в своём коде самостоятельно?

Краткий ответ - да.

Вирус гриппа действительно способен на такие мутации. Дело в том, что после копирования молекулы ДНК запускается белок для проверки "контрольной суммы". Он проверяет, что копия идентична оригиналу. Но проблема в том, что вирус гриппа основан на РНК с проприетарным механизмом копирования. Он вообще не запускает проверку "контрольной суммы". В результате уровень ошибок копирования чрезвычайно высок: примерно одна на 10000 базовых пар. И это при том, что весь геном гриппа состоит из 13000 базовых пар. То есть, грубо округляя, в каждой новой копии гриппа присутствует одна случайная мутация.

Некоторые из этих мутаций не имеют никакого значения, другие делают вирус безвредным, но некоторые очень редкие мутации могут сделать вирус более опасным. Поскольку вирусы размножаются и распространяются с астрономической скоростью, очень высоки шансы на то, что наш маленький хак произойдёт естественным образом.

Это одна из причин, я думаю, почему медицинские организации настолько озабочены распространением H1N1: у нас нет защиты от него, и хотя он пока не очень опасен, но через пару мутаций могут начаться действительно серьёзные проблемы.

В настоящее время патогенность H1N1 примерно такая же, как у обычного гриппа. В июне на 21449 подтверждённых случаев заболевания было всего 87 смертей, то есть смертность составляет 0,4%. Для сравнения, у "нормального" гриппа смертность <0,1%, у испанской разновидности в 1918 году смертность была 2,5%, а у разновидности H5N1 ("птичий" грипп) смертность превышает 50% (!), но он, к счастью, практически не передаётся от человека к человеку.

Заразившись H1N1 сегодня, вы получите ценный бонус практически безопасной выработки иммунитета, так что когда вирус мутирует и вернётся снова, вы уже будете под защитой.

Ещё одна проблема с системой копирования вируса гриппа заключается в том, что он хранит свой генетический код в восьми участках РНК, а не в одной неделимой цепочке. Из-за этого механизм репликации становится ещё более непредсказуемым. Если вам "повезло" заразиться двумя разными вирусами гриппа, то в вашем организме может появиться принципиально новый штамм гриппа, потому что в поражённых клетках вирусы гриппа обмениваются кодом в хаотическом порядке.

Вот почему дополнительная опасность H1N1 заключается в его уникальном свойстве, которое называют "тройной реассортацией". Он содержит фрагменты и человеческого, и свиного, и птичьего гриппа, и может свободно обмениваться кодом со своими "родственниками" из любого вида животных.


Эндрю ХУАН Перевод Анатолий АЛИЗАР

Опубликовано в блоге Bunnie: bunniestudios.com/blog/2009/06/on-influenza-a

Вс, 13 Сент, 2009, 14:55
Леонид Радзиховский: Это случилось в Польше

30 августа во время показательного выступления на авиашоу в Польше (г. Радом) рухнул самолет белорусских ВВС Су-27.

Два пилота: полковники Александр Марфицкий и Александр Журавлевич – могли катапультироваться.

Они этого не сделали – и погибли. Не катапультировались потому, что не хватило секунд – они уводили самолет от жилых домов.

Не стану вдаваться в причины аварии – не специалист. Например, в КБ «Сухой», разумеется, отрицают любые конструктивные недостатки, винят во всем белорусскую сторону, которая, мол, на свой страх и риск занималась «усовершенствованием» бортовых систем.

Может, и так. Кто смотрел замечательный фильм Абдарашитова и Миндадзе «Остановился поезд», может вспомнить, что там из-за всеобщего раздолбайства (в том числе своего собственного) погиб машинист, а после смерти из него «лепят героя».

Так вот – каковы бы ни были технические причины катастрофы, в данном случае героизм летчиков не вызывает ни малейшего сомнения – по какому самому строгому счету ни суди.

Все просто: могли катапультироваться – но не сделали этого.

Да, в уставах наверняка записано, что надо сделать все, чтобы минимизировать потери среди мирного населения. Но сколько раз мы слышали: «Самолет рухнул на жилой дом, погибли три человека, летчик успел катапультироваться». Что-то я не слыхал о суде над такими летчиками. Но даже если бы и был суд – что, расстреляют, что ли? Ну, в самом крайнем случае могут дать срок, и то вряд ли – слишком всегда много сложных технических деталей, которые можно трактовать и так, и сяк.
Read more )

Пт, 11 Сент, 2009, 12:04
Помяни Господи, во Царствии твоем.

Позавчера узнал, что умер мой ближайший друг по переписке. Алексей
Рубанов.
Read more )

Вс, 6 Сент, 2009, 22:07
Блестящий образ для обоснования мозговой гигиены.

a-lamtyugov.livejournal.com/

"... Почему-то до сих пор априори, по умолчанию, считаю, что на плечах у человека должна быть башка.

А потому каждый раз удивляюсь, наблюдая людей, у которых вместо башки там установлен в чистейшем виде турбореактивный двигатель. Или даже прямоточный.

ТРД, если кто не в курсе, с адской силой засасывает в себя воздух с одного конца, а потом, с еще более адской, выбрасывает его из другого. (Ну да, то, что летит из сопла -- это уже не совсем воздух, но для моей аналогии это несущественно).

И ему без разницы, что в себя засасывать. Хоть воздух, хоть мусор со взлетной полосы, хоть птиц, хоть зазевавшегося техника, хоть сайентологию, хоть сыроедение, хоть книжка по гомеопатии помогла, хоть все остальное.

Видели какие-нибудь ролики -- что может сделать удар реактивной струи? Значит, понимаете сами: когда такой наплечный ТРД начинает на полной тяге таскать за собой своего владельца, лупя по окружающим струей, картина всегда бывает феерическая. Запоминается надолго, если не на всю жизнь.

Рано или поздно в него попадет что-то такое, чего лопатки турбины и компрессора перемолоть не смогут. И тогда эти лопатки, под действием центробежных сил, радостно брызнут во все стороны, искромсав и хозяина, и то, что рядом оказалось.

Финал тем более закономерный, что наплечный ТРД словно СПЕЦИАЛЬНО ЗА ВСЯКИМ ГОВНОМ ГОНЯЕТСЯ. ЧТОБ ПОЛНЫМ ЗАБОРНИКОМ ХАПНУТЬ ..."

Вс, 2 Авг, 2009, 12:17
Свято место пусто не бывает

По наводке arnaut-katalan.livejournal.com прочитал статью: Виктория Смолкин
«Свято место пусто не бывает»: атеистическое воспитание в Советском Союзе, 1964--1968" и настоятельно советую сделать всем тоже самое.
http://magazines.russ.ru/nz/2009/3/sm5.html

Вт, 21 Июл, 2009, 00:27
В деревню, в глушьь

Молодой и основательный экс-киевлянин готовится к грядущему закату цивилизации

www.vicsrg.ho.com.ua/stat/ogorod.htm

На мой вкус, ему не хватает бытово-технического опыта. Водопровод в хате и даже сортир сделать все-же было бы можно. Может, еще доделает....

Вс, 5 Июл, 2009, 23:20
Хорошо об аде.

HTTP://homo-nudus.livejournal.com/193476.html

Пн, 15 Июн, 2009, 23:54
Интересно об Америке

www.oper.ru/torture/read.php?t=1045689264

20 most recent